Hierarchy For Package org.utgenome.gwt.utgb.client.bio

Package Hierarchies:

All Packages

Class Hierarchy

• java.lang.Object
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.ACGTEncoder
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.Alignment (implements com.google.gwt.user.client.rpc.IsSerializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.AlignmentResult (implements com.google.gwt.user.client.rpc.IsSerializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.ChrLoc (implements java.io.Serializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.ChrRange (implements com.google.gwt.user.client.rpc.IsSerializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.CIGAR (implements java.io.Serializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.CIGAR.Element (implements java.io.Serializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.CodonTable
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.CompactWIGData (implements org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.GraphData)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.Coordinate (implements com.google.gwt.user.client.rpc.IsSerializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.CytoBand (implements java.io.Serializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.DASResult (implements java.io.Serializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.DASResult.DASFeature.FeatureType (implements java.io.Serializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.DASResult.DASFeature.Group (implements java.io.Serializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.DASResult.DASFeature.Group.Link (implements java.io.Serializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.DASResult.DASFeature.Method (implements java.io.Serializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.DASResult.DASFeature.Target (implements java.io.Serializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.DASResult.DASGFF (implements java.io.Serializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.DASResult.Segment (implements java.io.Serializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.FASTASequence (implements com.google.gwt.user.client.rpc.IsSerializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.GenomeDB (implements java.io.Serializable)
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.DASLocation
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.GenomeRangeDataSet (implements java.io.Serializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.GenomeRangeVisitorBase (implements org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.GenomeRangeVisitor)
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.InfoSilkGenerator
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.Interval (implements java.lang.Comparable<T>, org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.GenomeRange, java.io.Serializable)
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.CDS
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.ChrInterval
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.Exon
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.Gap
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.Read
      • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.BlastResult
      • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.BSSRead
      • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.DASResult.DASFeature
      • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.Gene (implements java.io.Serializable)
        • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.BEDGene (implements java.io.Serializable)
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.ReadCoverage
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.ReadList
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.ReferenceSequence
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.SAMReadLight
      • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.SAMRead
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.SAMReadPair
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.SAMReadPairFragment
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.KeywordSearchResult (implements java.io.Serializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.KeywordSearchResult.Entry (implements java.io.Serializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.ReadQueryConfig (implements java.io.Serializable)
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.SAMReadFlag
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.WigGraphData (implements java.io.Serializable)

Interface Hierarchy

• org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.GenomeRangeVisitor
• java.io.Serializable
  • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.GenomeRange
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.GraphData

Enum Hierarchy

• java.lang.Object
  • java.lang.Enum<E> (implements java.lang.Comparable<T>, java.io.Serializable)
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.GenomeDB.DBType
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.CIGAR.Type (implements java.io.Serializable)
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.GraphWindow
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.Read.ReadType
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.AminoAcid
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.IUPAC
    • org.utgenome.gwt.utgb.client.bio.ReadQueryConfig.Layout